Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gabpb1Q00420 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms