Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx2Q00262 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms