Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbp10Q000W5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms