Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb4P99026 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms