Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cds1P98191 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cds1P98191 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms