Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VldlrP98156 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms