Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bmp1P98063 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bmp1P98063 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms