Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cry1P97784 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cry1P97784 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms