Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lig3P97386 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lig3P97386 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms