Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frg1P97376 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frg1P97376 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms