Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Meis3P97368 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Meis3P97368 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms