Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp1P97350 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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