Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vgll3P85442 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll3P85442 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms