Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Arf1P84078 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms