Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx1P83917 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms