Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx1P81068 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms