Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctps1P70698 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms