Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ldb1P70662 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms