Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tp53bp1P70399 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tp53bp1P70399 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms