Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfi1P70338 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfi1P70338 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms