Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vamp7P70280 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vamp7P70280 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms