Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Traf5P70191 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms