Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SbdsP70122 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SbdsP70122 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SbdsP70122 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms