Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd1P62315 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpd1P62315 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms