Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps11P62281 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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