Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rps29P62274 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms