Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ActbP60710 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ActbP60710 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ActbP60710 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ActbP60710 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ActbP60710 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ActbP60710 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms