Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp1P58466 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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