Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms