Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn4P57780 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms