Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NcstnP57716 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms