Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn18P56857 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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