Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmoP56726 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmoP56726 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmoP56726 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SmoP56726 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SmoP56726 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms