Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms