Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GemP55041 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GemP55041 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GemP55041 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GemP55041 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GemP55041 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms