Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc12a1P55014 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc12a1P55014 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc12a1P55014 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc12a1P55014 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc12a1P55014 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc12a1P55014 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms