Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrlP54846 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrlP54846 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrlP54846 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NrlP54846 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrlP54846 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NrlP54846 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms