Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ephb3P54754 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms