Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cux1P53564 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cux1P53564 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms