Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fgd1P52734 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fgd1P52734 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms