Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Upp1P52624 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms