Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Matn1P51942 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Matn1P51942 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Matn1P51942 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Matn1P51942 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Matn1P51942 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Matn1P51942 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Matn1P51942 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms