Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apobec1P51908 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms