Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccr5P51682 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccr5P51682 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms