Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn1swP51491 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn1swP51491 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms