Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RoraP51448 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RoraP51448 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RoraP51448 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RoraP51448 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms