Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pa2g4P50580 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pa2g4P50580 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms