Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SftpbP50405 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SftpbP50405 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms