Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms