Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms